MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 13860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	TG	3	6	18	23	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008563	A	7	7	28	34	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008563	AGC	2	6	46	51	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008563	CAGA	2	8	137	144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008563	ACA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008563	CAC	2	6	185	190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008563	ACC	3	9	195	203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008563	A	6	6	255	260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008563	T	8	8	283	290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008563	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008563	T	6	6	5051	5056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008563	GAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008563	AAC	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008563	A	7	7	6363	6369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008563	AAG	2	6	7886	7891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008563	TA	3	6	7892	7897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008563	GGCG	2	8	7954	7961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008563	CGG	2	6	8018	8023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008563	CGT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008563	ATC	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008563	CTGT	2	8	9107	9114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008563	C	6	6	9767	9772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_008563	G	6	6	9777	9782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008563	TGA	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008563	TCT	2	6	9840	9845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008563	AT	3	6	9850	9855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008563	CGC	2	6	9894	9899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008563	GTT	2	6	9922	9927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008563	G	6	6	9949	9954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008563	ATC	3	9	10544	10552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008563	GAAT	2	8	10553	10560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008563	AAT	2	6	10566	10571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008563	ATA	2	6	10607	10612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008563	GAAAAT	2	12	10650	10661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008563	TGG	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008563	CTG	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008563	TTA	2	6	11910	11915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008563	T	6	6	11919	11924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008563	ATTC	2	8	11944	11951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008563	TTG	2	6	11967	11972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008563	A	6	6	12024	12029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008563	TGA	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008563	TAG	2	6	12072	12077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008563	AGTG	2	8	12086	12093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008563	A	7	7	12101	12107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008563	ATG	2	6	12163	12168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008563	AT	3	6	12174	12179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008563	A	6	6	14193	14198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008563	CCG	2	6	15423	15428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008563	GCC	2	6	15523	15528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008563	CGG	2	6	15533	15538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008563	ATC	2	6	15565	15570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008563	TGC	2	6	15577	15582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008563	CT	3	6	15590	15595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008563	GACA	2	8	15717	15724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008563	CGC	2	6	15737	15742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008563	TAT	2	6	15743	15748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008563	CT	3	6	15753	15758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008563	AATC	2	8	15814	15821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008563	TTA	2	6	15916	15921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008563	AGA	2	6	15936	15941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008563	GAATT	2	10	15961	15970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008563	AC	3	6	16023	16028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008563	A	8	8	16172	16179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008563	ATA	2	6	18484	18489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008563	AATGT	2	10	18490	18499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008563	AAT	2	6	19876	19881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008563	TTC	2	6	19882	19887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008563	TCA	2	6	19928	19933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008563	GCC	2	6	19934	19939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008563	TC	3	6	19962	19967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008563	GAT	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008563	GA	3	6	21315	21320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008563	A	7	7	22272	22278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008563	T	7	7	22293	22299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008563	ACA	3	9	22309	22317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008563	TTG	2	6	22333	22338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008563	AGC	2	6	22398	22403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008563	GCA	2	6	22447	22452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008563	TGA	2	6	22490	22495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008563	CAT	2	6	22503	22508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008563	GC	3	6	22555	22560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008563	CTT	2	6	22650	22655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008563	GCA	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008563	TTC	2	6	22789	22794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008563	CTT	2	6	22826	22831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008563	GATGC	2	10	27222	27231	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008563	TGC	2	6	27258	27263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008563	AGC	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008563	T	6	6	28767	28772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008563	TCCC	2	8	30136	30143	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008563	TGGC	2	8	30177	30184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008563	ACA	2	6	31096	31101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008563	TGT	2	6	31213	31218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008563	T	6	6	31249	31254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008563	TCT	2	6	31278	31283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008563	TGC	2	6	31284	31289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008563	CATG	2	8	31346	31353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008563	ATA	2	6	31363	31368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008563	A	6	6	31370	31375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008563	GCC	2	6	31418	31423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008563	TCG	2	6	31437	31442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008563	TCA	2	6	31468	31473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008563	TGA	2	6	35973	35978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008563	T	7	7	35985	35991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008563	TTA	2	6	36051	36056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008563	AG	3	6	36647	36652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008563	GGA	2	6	36689	36694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008563	TATT	2	8	36695	36702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008563	TGA	2	6	36740	36745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008563	GATGC	2	10	37314	37323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008563	CGA	2	6	37389	37394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008563	GAC	2	6	38807	38812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008563	A	6	6	38824	38829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008563	ATT	2	6	38851	38856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008563	GGGC	2	8	40473	40480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008563	TGAC	2	8	40496	40503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008563	GCG	2	6	41773	41778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008563	ATTT	2	8	44572	44579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008563	GTTT	2	8	44589	44596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008563	ATT	3	9	44620	44628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008563	T	6	6	44727	44732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008563	ATT	2	6	44744	44749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008563	TGT	2	6	44768	44773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008563	A	7	7	44778	44784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008563	GAG	2	6	44866	44871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008563	TTG	2	6	48151	48156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008563	GCT	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008563	AAG	2	6	48222	48227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008563	CTGGGG	2	12	48291	48302	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008563	CG	3	6	48328	48333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008563	A	7	7	48405	48411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008563	TC	3	6	49768	49773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008563	ATT	2	6	49788	49793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008563	AT	3	6	49811	49816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008563	TGTT	2	8	52283	52290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008563	CA	3	6	53022	53027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008563	ACCGTC	2	12	53035	53046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008563	A	6	6	53128	53133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008563	GCA	2	6	53137	53142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008563	TGA	2	6	53196	53201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008563	TGA	2	6	53217	53222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008563	CGC	2	6	53276	53281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_008563	TTG	2	6	53314	53319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008563	CCA	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_008563	GC	3	6	53501	53506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008563	CAA	2	6	57927	57932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_008563	CAT	2	6	60307	60312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008563	AGC	2	6	61425	61430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008563	GCG	2	6	61460	61465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008563	ACC	2	6	65122	65127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_008563	GTG	2	6	65149	65154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_008563	A	7	7	71884	71890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_008563	A	7	7	71920	71926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_008563	G	7	7	73063	73069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008563	TTC	2	6	73082	73087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_008563	AT	3	6	73102	73107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008563	ATT	2	6	73157	73162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_008563	CAT	2	6	73236	73241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_008563	GTT	2	6	73361	73366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008563	A	6	6	73368	73373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008563	ATTC	2	8	73467	73474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_008563	A	7	7	73493	73499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008563	ATA	2	6	73509	73514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008563	ATT	2	6	73530	73535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008563	T	8	8	73545	73552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_008563	ATC	2	6	73766	73771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_008563	A	6	6	73789	73794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008563	GAA	2	6	74874	74879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_008563	CGC	2	6	75855	75860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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188	NC_008563	AAT	2	6	81001	81006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_008563	CAT	2	6	81175	81180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_008563	T	6	6	81234	81239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_008563	A	7	7	85999	86005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_008563	A	6	6	86081	86086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_008563	ATA	2	6	108972	108977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_008563	TTA	2	6	110664	110669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_008563	CAC	2	6	121015	121020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_008563	TGT	2	6	123923	123928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_008563	TCA	2	6	124072	124077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_008563	AATA	2	8	124201	124208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008563	TAA	2	6	124214	124219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_008563	ATA	2	6	124251	124256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008563	AAT	2	6	124289	124294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008563	A	6	6	124348	124353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008563	ATA	2	6	126455	126460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_008563	TA	3	6	126465	126470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_008563	GGAT	2	8	190011	190018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008563	A	8	8	190081	190088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_008563	ATT	2	6	190110	190115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008563	TG	4	8	197599	197606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008563	GTCTG	2	10	197610	197619	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
453	NC_008563	CGC	2	6	198225	198230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_008563	GGC	2	6	198255	198260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_008563	CCT	2	6	219040	219045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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482	NC_008563	ATT	2	6	227377	227382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_008563	TAT	2	6	227383	227388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_008563	CGGTT	2	10	228252	228261	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
489	NC_008563	TG	3	6	228383	228388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_008563	GGC	2	6	228537	228542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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